有些患者虽然感染了贾第虫，但不一定会出现任何症状。不过由于是携带者，他仍可能通过粪便等将寄生虫传播给他人。如果感染后得病，症状通常在感染后 1-2 周出现，包括：
- 水样腹泻 (有时伴恶臭)，或者带油滴糊状便，或者两者交替；
- 乏力；
- 腹部痉挛性疼痛和胀气；
- 恶心；
- 体重减轻 (可能多达 10%)；
如果腹泻在一周甚至更短的时间里自我改善了，那么这很可能不是由贾第虫病所引起的。因为在一般情况下，贾第虫病的症状改善需要 2-6 周的时间，而有些患者会变为慢性，症状可能会持续几个月甚至几年。
并发症
贾第虫感染一般不会有任何的生命危险，但其症状可能会持续存在，并引起严重的并发症，尤其是对于婴幼儿和5岁以下的儿童。最常见的并发症包括：
- 脱水： 所谓脱水，即人体缺少足够的水分来行使其正常的功能。这通常是由于严重腹泻所导致的。
- 发育迟缓： 因贾第虫感染而引起的慢性腹泻可能会导致营养不良，从而影响儿童体格和智力的发育。
- 乳糖不耐受： 很多感染贾第虫的患者会出现乳糖不耐受 (即不能很好地消化乳糖)。即使寄生虫被清除后，这种情况可能还会持续很久，以至于可能导致营养不良和体重减轻。
- 皮疹： 比较少见的病例中，贾第虫感染会引起皮疹或者荨麻疹。