在乳糜泻患者的体内，某些抗体的水平较正常人高。抗体是一些特异性的蛋白质，它们是人体免疫系统的组成部分，负责清除侵入体内的有害外来物质。不知什么原因，乳糜泻患者的免疫系统可能误将摄入的谷蛋白视为有害的外来物质，因此分泌大量的抗体来对付这些谷蛋白，在患者的血液中往往可以检测到这种水平升高的抗体。这种抗体检测方法可以用来初步筛查是否患有乳糜泻，不过如果要确诊的话，医生需要使用一个很细的、可以弯曲的内窥镜经口腔、食道、胃部到达小肠，摄取一小块小肠组织，然后在显微镜下观察小肠绒毛的损伤情况。
虽然在很多时候通过试验 “无谷蛋白饮食” 后症状是否改善也可以帮助确诊乳糜泻，但最好不要在咨询医生之前擅自进行这种试验，因为如果您在医生不知情的情况下采用 “无谷蛋白饮食”，那么在进行抗体检查或小肠组织显微镜检查时可能会出现假阴性的结果。